De scheepsevolutie en de stijging van het containerverkeer heeft de Vlaamse overheid er toe aangezet , om de laatste jaren te investeren in de de maritieme toegang van de 4 zeehavens:
De Vlaamse overheid is verantwoordelijk voor de maritieme toegang. Het commercieel gedeelte van de havens valt onder de bevoegdheid van de havenbedrijven. De onderhoudsbaggerwerken uitgevoerd aan de commerciële ligplaatsen in de havens van Zeebrugge en Gent worden aangerekend aan de havenbedrijven. In de haven van Antwerpen, voert het havenbedrijf op de rechteroever baggerwerken uit met het eigen baggerbedrijf, ook in de gedeelten van de haven die als maritieme toegang zijn afgebakend. Na controle en opvolging betaalt het Vlaamse Gewest deze baggerkosten terug aan het havenbedrijf.
Op 20 juli 2006 heeft de Vlaamse regering de afbakening van het begrip maritieme toegangswegen in haar besluit aangepast zodat ook getijdedokken, zoals onder meer het Deurganckdok (Haven Antwerpen) en de dokken in de voorhaven van Zeebrugge er onder vallen. Dit gebeurde na akkoord van de Europese Commissie.